实验体（00001），代号帕西菲尔，宝条S计划中的第一产物，早于萨菲罗斯而出现，融合了古代种，人类，以及杰诺瓦的三种基因细胞，原本古代种与杰诺瓦的细胞是处于极端的状态，但由于人类细胞的存在而达到了中和作用，因此，宝条判定代号帕西菲尔的实验体会拥有古代种对自然的亲和力以及杰诺瓦吞噬的双重力量。
而在接下来的研究中，帕西菲尔与杰诺瓦细胞的融合率一直在稳步攀升，但最终停留在了百分之九十九，且生命体征远远弱于其他的实验体，连普通的人类都不如，这一点令宝条百思不得其解，在经过数年努力而没有改善后，他选择抛弃帕西菲尔，标记为失败品，在采集够了样本与复制体实验数据后，继续进行S计划，实验体（00002）代号萨菲罗斯诞生，从血缘上来讲，还是他的儿子，而这一次的结果终于让他满意了。
我们的故事也就是从这里开始，被作为失败品的帕西菲尔苏醒……