戴芳香盗取小鬼子要炸毁钓鱼岛，从中得益的yin谋，为了将机密送出，却被抓。
头部再次受到重创的林混，被一对哲彭渔家所救，却被当地黑社会的鱼逊买走，成为一个黑市拳手。
为了生存，他不得不杀掉一个个对手，也在杀戮中，得到了其他拳手的尊重，收获了友谊。
打黑拳的过程中，林混的记忆被黑社会老大鱼逊清洗，埋下了杀戮的种子，并且被注she大量的基因液，变成一个基因拳手。而基因拳手，却是炸毁钓鱼岛的重要能源。因为剂量过大，生化中的林混失控，救出了对自己有恩情的千渡云纱，并且逃走。
恩雅解除了鱼逊的催眠，将林混恢复。
得知了平岛计划的yin谋，林混采取了步步为营的办法，想通过两条线，查出平岛计划的细节。一是百岁的老妖女原731部队的乙津芳子，他身边的唐龙正是林混最早的任务之一，他们握有丧尸的制作方法，复活了二战东条英机、石井四郎等人，林混被俘虏。另一条线是救出被关在和歌山女子监狱的戴芳香，和歌山正处于杀鲸节，海豚惨遭屠戮，在救助海豚和戴芳香的过程中，他发现了一个巨大的秘密。
两条线索合一，但是到了钓鱼岛，他发现平岛计划的细节却发生了变化，更大的yin谋在等着他。