彭大在义军之中素来以雷厉风行著称，此番定下防疫之策后，军令一下，全军上下无一人敢怠慢。
叶兑先生凭借其在宿州城内多年积累的威望和对物资储备的熟悉，倾尽全力协助调配。
他虽是一介文士，此刻却展现出了惊人的干练与效率。一车车的生石灰、成捆的艾草、大瓮的醋、以及粗布麻布，被紧急从州衙府库和城内药铺、杂货店征调出来，源源不断地运往城外大营。
城中百姓虽对义军心存疑虑，但见是德高望重的叶先生主持，且是为了防治疫病，大多都予以配合，甚至有些商户还主动降价售卖。
胡大海带着一帮信得过的弟兄——多是昔日一起屠宰牲口的伙伴，以及身体尚健的后勤营义军士卒，投入到了营区清理工作中。挖掘深坑，将堆积如山的垃圾、人畜粪便等秽物彻底掩埋；用木桶打来清水，混合生石灰，制成石灰水，仔细泼洒营区地面，尤其是病患隔离区周围，进行消毒；那些病患使用过的、沾满污秽的草垫、破烂被服，则被集中起来，用烈火焚毁。
柳莺儿在此番防疫中，更是让营中上下见识了何为巾帼不让须眉。
她先是派人在城中张贴告示，召集愿意出力的妇女，不过半日便聚集了百余人。众人在营内空地上架起数十个针线筐，柳莺儿亲自示范，按照陈慕之所画的简图，将粗布剪成相应形状，浸过艾草、金银花熬制的药汁，晒干后叠成四层，再用棉线缝边，制成简易却实用的厚布口罩。
白日里，她领着众人赶制口罩，夜里则让人支起几口大锅，按陈慕之所给的方子，往沸水里加入姜片、葱白与甘草，熬成一锅锅冒着热气的散寒解毒汤水。天刚蒙蒙亮，她便带着人提着木桶，挨营帐分发汤水，还耐着性子穿梭在各营帐间，反复宣讲那些 “新奇规矩”，有士卒嫌麻烦不愿听，她也不恼，只是拿着药皂与瓦盂，手把手教对方如何使用，直到对方点头应下才肯离开。
陈慕之本人则坐镇于临时划出的“防疫指挥中心”——一座靠近营区边缘、相对通风的旧帐篷。这里成了整个防疫体系的大脑。
他结合自己对病患的近距离观察和医士们的详细描述，不断细化隔离方案：将病患严格按照轻、重、危三级进行管理，划定明确且互不交叉的隔离区域，限制非必要的人员流动，尤其是严禁健康士卒随意接近病区。
他亲自指导那些自愿留下的医士和少数胆大的护理人员，如何正确佩戴和清洗“口罩”，如何用醋熏、艾草燃烟的方式进行空气消毒，并反复强调自身防护的重要性：“诸位先生、兄弟，救治他人固然重要，但务必先保护好自己！若你们都倒下了，还有谁来救治病患？切记，接触病患前后，务必洗手，口罩尽可能戴好！”
对于重症者，陈慕之虽无特效药，但也提出了一些辅助疗法，以期缓解痛苦，争取生机。
他指导护理人员用温水擦拭高热病人的身体，辅助物理降温；鼓励意识尚清的病人多饮温开水，补充水分，促进新陈代谢；他还尝试用蜂蜜、少量猪脂混合甘油，隔水加热融化后冷却，制成一种简单的润喉膏，让咳嗽剧烈的病人含服，以缓解咽喉的肿痛和干痒。
这些措施看似简单，却在一定程度上减轻了病人的痛苦，也让那些原本对陈慕之半信半疑的医士们，开始对他刮目相看。
好在宿州城内暂未发现病例，这对于这支义军来说也是不幸之中的万幸了。十数日之后，军中发病人数渐渐下降，陈慕之不由得松了口气。
这日巳时，营门处忽然传来一阵喧哗，打破了防疫期间的平静。
为防病菌扩散，陈慕之早已让人在兵营出入口设卡，凡有急事出营者，须由两位同营士兵证明五日内未接触过患病者，并经一位城中请来的郎中检查——用手背试探额温，确认无发热、咳嗽等症状，登记姓名与事由后，方可签发证明放行。
可偏有一人不遵规矩 —— 此人正是副将赵德怀的表弟王三。王三本是营中负责看管兵器的小旗，因沾了赵德怀的光，平日里在营中颇为横行。今日他借口城中母亲的病重，要出城探望，却不愿履行检查手续，仗着自己是副将亲戚，硬要冲卡。
“我乃赵副将表弟，尔等小小卫兵，也敢拦我去路？” 王三挺着胸脯，双手叉腰，指着守门卫兵和老郎中的鼻子骂道，“不过是些看门口的，也配管到老子头上？识相的就赶紧让开，免得老子动手！”
那拦住他的队长不过二十出头，虽惧王三的身份，却也记着陈慕之“防疫规矩面前，人人平等” 的叮嘱，依旧双手横握长枪，挡在城门前：“非是小的不敬，只是防疫规矩在此，凡出营者须履行检查手续，确认无疫病症状方可放行。您若要出城，还请配合军令把两个证明人找来并经医护检查，莫要让小的难做。”
“军令？屁的军令！我看你们就是故意刁难！”王三越发嚣张，一把推开卫兵，就要硬闯。
场面一时混乱。正在附近巡视的胡大海闻声赶来，了解到事情的经过后，浓眉倒竖，大步上前，如同铁塔般挡在王三面前，声若雷霆：“干啥呢？！彭大将军的令箭在此，谁敢不遵？！”
王三被胡大海的气势所慑，气焰稍敛，但嘴上仍不饶人：“胡屠户，你少拿鸡毛当令箭！我有急事要进城！”
胡大海可不吃这一套，瞪眼道：“有急事也得按规矩来！先把证明人找来，再让郎中给他查！”
王三一脚把营前挡门的木栏踢倒：“我不需要谁来证明！郎中的脏手也别碰我！”
胡大海彻底怒了，喝道：“来人！把这违抗军令、扰乱防疫的家伙给我拿下！”
左右兵卒见胡大海发话，又占着理，当即一拥而上，将挣扎叫骂的王三捆了个结结实实。
事情很快报到彭大那里。彭大正在与叶兑、陈慕之商议防疫后续事宜，闻报后脸色一沉。
他深知军中纪律的重要性，尤其是在防疫这等关乎存亡的大事上，若因一人而废，必将前功尽弃。他看了一眼身旁的副将赵德怀，冷冷道：“赵副将，你的表弟，你看该如何处置？”
赵德怀脸上青一阵白一阵，他心中对陈慕之这套“繁琐”的防疫措施本就颇不以为然，觉得是书生之见，劳民伤财，此刻见表弟受辱，更是怒火中烧。
但他深知彭大的脾气，此刻若求情，只怕适得其反，只得咬牙道：“大将军，卑职治家不严，甘愿受罚。这孽障违抗军令，理应严惩！但……但念其初犯，是否……”
彭大一摆手，打断了他的话，斩钉截铁地说：“防疫如救火，军令如山！任何人不得例外！王三违抗军令，冲击防疫关卡，杖责三十！以儆效尤！赵副将教侄无方，罚饷一月！执行！”
命令一下，王三被当众扒去裤子，按在条凳上，结结实实挨了三十军棍，打得皮开肉绽，哭爹喊娘。赵德怀在一旁看着，脸上肌肉抽搐，心中对陈慕之的怨恨达到了顶点。在他看来，这一切都是陈慕之惹出来的祸事！若不是这酸秀才搞什么劳什子防疫，怎会有今日之辱？他将这笔账，牢牢记在了陈慕之头上。
日子一天天过去，在各方的齐心协力下，营中的疫病终于得到了有效控制。
新增病患日渐减少，每日都有轻症者康复出院；即便是危重症者，在精心照料下，死亡率也大幅下降。
待最后一名重症者退烧好转，能正常进食后，负责统计病情的医士兴冲冲地跑到防疫指挥中心，对陈慕之拱手道：“陈先生！大喜！营中已无新增病患，所有病患均已康复或好转，这场疫病，咱们算是打赢了！”
消息传开，营中士卒无不欢呼雀跃，不少人自发来到陈慕之的帐篷外，高声喊道：“多谢陈先生！多谢陈先生救我等性命！”
陈慕之走出帐篷，看着眼前欢呼的人群，心中百感交集——从魂穿元末，到如今带领众人打赢这场防疫战，所有的辛苦与奔波，在这一刻都有了回报。
柳莺儿与胡大海也走了过来，柳莺儿眼中带着笑意，轻声道：“慕之哥哥，你看，我们做到了。”胡大海则拍了拍陈慕之的肩膀，哈哈大笑道：“慕之兄弟，好样的！这下，谁也不敢说你是只会读书的酸秀才了！”
可谁也没想到，一场新的风波，竟在此时悄然酝酿。副将赵德怀本就因王三受罚之事对陈慕之心存不满，又见陈慕之在军中威望日渐提升，心中更是嫉妒。
他与芝麻李麾下大将赵均用本是同村，素来交好，私下里往来甚密。这日，赵德怀悄悄派人给赵均用送去一封密信，信中添油加醋地描述了陈慕之在宿州推行防疫之事，称其“耗费钱粮无数，却无实效”“定苛责规矩，欺压弟兄，荒废训练”，还暗示彭大“偏袒陈慕之，不顾军中团结”。
赵均用本就与彭大有隙——两人虽同为义军将领，却因权力分配问题多有摩擦。赵均用见信后，心中顿时有了算计：若能借此机会打压彭大，自己在义军中的地位便能更进一步。
于是，他当即拜见芝麻李：“大帅，彭大在宿州搞那所谓的防疫，纯属劳民伤财！据属下所知，他为了买生石灰、做口罩、熬汤药，前前后后花了近数千两银子，这些可都是义军的救命钱粮啊！可到头来，也没见他彻底根除疫病，不过是延缓了几日扩散罢了。”
“更过分的是，他还让那个外来的书生陈慕之定了些古怪规矩，动不动就责罚弟兄——前几日，赵副将的表弟不过是想出城探母，就被杖责三十，还关了禁闭。如今军中人心惶惶，弟兄们都怨声载道，这不是破坏军队团结吗？依属下看，彭大此举，怕是另有私心，想借着防疫之名，拉拢人心，扩充自己的势力啊！”
芝麻李本就对彭大在宿州的动作有些疑虑——他觉得疫病乃是 “天谴”，只需祈祷上苍庇佑，无需如此大费周章。
如今听了赵均用的话，虽不全信，但更心生疑虑，为稳妥起见，当即道：“来人，传我命令，着彭大即刻返回徐州，当面解释此事，队伍暂交由副将代管！”
传令兵快马加鞭赶到宿州时，彭大正在与陈慕之、叶兑等人商议后续民生恢复之事。
听闻芝麻李要自己即刻返回徐州，彭大心中虽有不满，却也不敢违抗军令——芝麻李毕竟是义军的首领，自己若拒不从命，恐会落下 “抗命不遵” 的罪名，他当即向众人交代后续事务。
“叶先生，” 彭大看向叶兑，神色严肃道，“宿州刚经历战火与疫病，民生凋敝，百姓困苦。我走之后，宿州民政便交由你打理，你务必安抚好百姓，开仓放粮，救济灾民，同时保障军中粮草供应，不可出半点差错。”